확률적 유전자 발현의 평균·분산 제어를 위한 인실리코 PI 제어

본 논문은 단순 유전자 발현 네트워크에서 단백질 평균과 분산을 원하는 값으로 조절하기 위해 인실리코(컴퓨터 기반) 비례‑적분(PI) 제어기를 설계한다. 평균만 제어할 경우 단일 PI 제어로 전역적·강인한 추적이 가능하고, 평균과 분산을 동시에 제어하려면 mRNA 분해율을 추가 입력으로 사용한 다변량 PI 제어가 필요함을 보인다. 또한, 단백질 이합체 형성 시스템에서도 순간 적분 제어만으로 평균을 안정적으로 조절할 수 있음을 증명한다.

저자: Corentin Briat, Mustafa Khammash

확률적 유전자 발현의 평균·분산 제어를 위한 인실리코 PI 제어
본 논문은 세 부분으로 구성된 체계적인 연구를 통해, 확률적 유전자 발현 시스템의 평균 및 분산을 인실리코(컴퓨터 기반) 제어기로 조절하는 방법론을 제시한다. **1. 서론 및 배경** 유전자 발현의 변동성은 세포 수준에서 중요한 현상이며, 이를 제어하기 위한 두 가지 접근법이 있다. 하나는 세포 내부에 생물학적 회로를 삽입하는 ‘인-비보(in‑vivo)’ 제어이며, 다른 하나는 외부에서 측정·제어 신호를 주는 ‘인-실리코(in‑silico)’ 제어이다. 후자는 광유전학, 마이크로플루이딕스 등으로 전사율을 조절하고, 형광 단백질을 통해 평균·분산을 실시간 측정한다. 본 연구는 이러한 인-실리코 환경을 전제로, 확률적 반응 네트워크의 모멘트 방정식을 이용해 제어 설계를 수행한다. **2. 평균 제어를 위한 단일 PI 제어기** 먼저 가장 단순한 4단계 유전자 발현 모델(전사, mRNA 분해, 번역, 단백질 분해)을 고려한다. 평균 동역학은 선형 2차 시스템 \

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